PickinPixels opererer på et tile-baseret lærredssystem, hvor hver pixel fungerer som en uafhængig tegnbar enhed med RGB-farvedata og alfakanal-gennemsigtighed. Editoren understøtter lærredsdimensioner fra 8x8 op til 256x256 pixels, med realtidsgitteroverlay, der tilpasser sig zoomniveauer mellem 100% og 3200%.
Lagarkitekturen implementerer ikke-destruktiv redigering gennem en stakbaseret renderingspipeline. Hvert lag opretholder sin egen pixelbuffer, blandetilstand og uigennemsigtighedsværdi. Systemet behandler lagsammensætning fra bund til top under eksport og anvender alfablandingsberegninger i realtid. Brugere kan skifte lagsynlighed, låse redigering og justere staklingsrækkefølge gennem den dedikerede lagpanelgrænseflade.
Animationsfunktionalitet er afhængig af frame-sekventering med justerbare afspilningshastigheder fra 1 til 60 frames pr. sekund. Hver frame refererer til en komplet lærredstilstand, inklusive alle aktive lag. Løgskalsfunktionen overlægger forrige og næste frames ved 30% uigennemsigtighed for at hjælpe med bevægelseskontinuitet. Eksportmuligheder inkluderer animeret GIF med loop-antal kontrol og PNG sprite sheet-generering med tilpasselig frame-afstand.